A bexiga pode ser afetada pela endometriose, assim como todos os demais órgãos da pelve. Da mesma forma que ocorre com as lesões de endometriose intestinal, a endometriose segue um padrão previsível de acometimento das camadas da bexiga, desde sua camada externa e superficial (serosa), passando pela camada muscular (conhecida como músculo detrusor), até, eventualmente, a camada interna (mucosa).
Os sintomas mais frequentes são o aumento da frequência urinária, além da dor pélvica ao enchimento e ao esvaziamento da bexiga. Quando a endometriose atinge a camada mucosa interna, pode haver sangramento na urina.
O diagnóstico da endometriose de bexiga pode ser feito por ultrassonografia transvaginal com preparo intestinal e/ou ressonância magnética pélvica, realizados por profissionais habituados ao diagnóstico. A cistoscopia diagnosticará apenas as lesões que atingiram a camada mucosa interna, que representam menor parte das lesões de endometriose de bexiga.